Древние бактерии хадза и чимане: микробиота как зеркало прошлого и здоровья
Новые данные свидетельствуют, что сотни видов бактерий обитали в кишечнике людей на протяжении тысячелетий и вместе с людьми расселялись по миру после выхода из Африки. Эти выводы сделаны группой учёных из Стэнфордского университета и коллег; результаты опубликованы в престижном научном издании. При этом многие древние микробы сегодня встречаются редко или исчезают у жителей развитых стран.
Ученые изучили образцы кала 85 взрослых представителей народа чимане, коренных жителей боливийской Амазонии, которые занимаются земледелием и сбором пищи. Образцы собирали в 2009 году и в 2012–2013 годах. По ним удалось восстановить геномы бактерий, относящихся к 1408 видам, и затем сравнили их с данными хадза.
Несмотря на это, около 87,4% обнаруженных видов чимане нашли своё отражение у хадза. Примерно 60% общих видов встречаются редко или не встречаются вовсе в индустриальных странах. Чтобы понять, передались ли эти микробы от общих предков или появились позже, учёные сравнили генетические различия между бактериями одного вида у чимане и хадза.
Выяснилось, что за последние примерно пять тысяч лет обмен бактериальными штаммами между двумя народами происходил редко — у 545 из 636 проанализированных видов следов такого обмена не обнаружено вовсе.
Нашлись и исключения. У некоторых бактерий Akkermansia muciniphila, Bacteroides ovatus и кишечной палочки штаммы чимане и хадза оказались почти так же близки к мировым аналогам. Такие бактерии чаще встречаются у жителей индустриальных стран. По мнению исследователей, эти виды попали к чимане и хадза сравнительно недавно, через контакты с другими народами.
Многие общие виды ранее относили к исчезающим бактериям, которых больше у хадза, чем у жителей индустриальных стран. Авторы отмечают, что утрата таких микробов может быть связана с повышенным риском ряда хронических метаболических и воспалительных заболеваний, и допускают, что возвращение таких бактерий могло бы помочь здоровью людей. Однако любые шаги требуют обсуждения с этическими и коренными общинами.
